O Conselho Geral é o órgão de direção estratégica responsável por linhas orientadoras da atividade da Escola, assegurando a participação e representação da comunidade educativa.
A Direção é o órgão de administração e gestão do Agrupamento de Escolas Júlio Dinis, nas áreas pedagógica, cultural, administrativa e financeira.
O Conselho Pedagógico é o órgão de coordenação e supervisão pedagógica e orientação educativa do Agrupamento de Escolas, nomeadamente nos domínios pedagógico-didático, da orientação e acompanhamento dos alunos e da formação inicial e contínua do pessoal docente e não docente.
O Conselho Administrativo é o órgão deliberativo em matéria administrativo-financeira do Agrupamento de Escolas, nos termos da legislação em vigor.